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(1)實(shí)驗(yàn)簡(jiǎn)介
焦磷酸測(cè)序可在一次檢測(cè)中快速定量一個(gè)或多個(gè)甲基化位點(diǎn),是目前最理想的驗(yàn)證方法。因此該技術(shù)在表觀遺傳學(xué)研究中逐漸成為數(shù)據(jù)分析的金標(biāo)準(zhǔn)。本公司基于QIAGEN公司的PyroMark Q96 ID平臺(tái),應(yīng)用焦磷酸測(cè)序(Pyrosequencing)技術(shù),不僅解決了常規(guī)的焦磷酸測(cè)序法在非CpG位點(diǎn)胞嘧啶轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶時(shí)影響到引物的結(jié)合,進(jìn)一步提高了結(jié)果的準(zhǔn)確性;能提供基于序列測(cè)定SNP檢測(cè)、等位基因頻率分析、甲基化檢測(cè)、雜合子缺失及細(xì)菌、病毒分型等技術(shù)服務(wù)。
(2)實(shí)驗(yàn)流程
① DNA提取及純化
② 亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化
③ PCR擴(kuò)增
④ 焦硫酸測(cè)序
⑤ 甲基化定量
⑥ 實(shí)驗(yàn)完畢,提供完整的實(shí)驗(yàn)報(bào)告,包括實(shí)驗(yàn)方法與步驟、數(shù)據(jù)分析、實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
(3)技術(shù)優(yōu)勢(shì):
① 先進(jìn)的算法設(shè)計(jì)可優(yōu)化最佳的實(shí)驗(yàn)條件,內(nèi)嵌式的質(zhì)控保證數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確可靠,全程的軟件控制減少人為因素的影響;
② 靈敏度高,可測(cè)到鄰近CpG區(qū)域的單個(gè)甲基化水平,甚至包括測(cè)序的引物區(qū)域;
③ 周期短、通量高,1h內(nèi)可同時(shí)平行分析96個(gè)樣本,一次運(yùn)行可實(shí)現(xiàn)多個(gè)連續(xù)CpG位點(diǎn)定量分析;
④ 除常規(guī)的檢測(cè)位點(diǎn)變化情況外,還可準(zhǔn)確計(jì)算頻率變化;
⑤ 對(duì)于檢測(cè)位點(diǎn)要求低,可檢測(cè)未知序列信息,覆蓋到人類基因組的所有CpG位點(diǎn);
⑥ 對(duì)于樣品要求低,適用于新鮮、冷凍和FFPE樣本;